Водородният компресор е технология, която използва водороден компресор като ядро ​​за компресиране и транспортиране на газ чрез промяна на неговия обем. Прилага се в станции за зареждане с водород, химическа промишленост и съхранение на енергия. Компресорите се разделят на две основни категории: механични (с диафрагма и хидравлично задвижване) и не-механични. Мембранните компресори представляват 70% от пазара, докато йонните компресори (като тези от Linde Group в Германия, които са постигнали приложения с налягане от 110MPa) са в процес на разработка. Мембранните компресори използват три-слойна метална диафрагма за постигане на нулево-компресиране на замърсяване, докато компресорите с хидравлично задвижване имат предимството на компактна структура, но представляват риск от изтичане на водород. Основните местни производители включват Zhongding Hengsheng и Fengdian Jinkaiwei.

Структурата на водородния компресор включва основни компоненти като картер, колянов вал и свързващ прът, както и компоненти като цилиндров блок, бутало и охладител. Коефициентът на компресия на един- етап обикновено е 3:1 до 4:1, а максималното работно налягане може да достигне 90MPa, като например 90MPa хидравлично задвижван водороден компресор. При сценарии на станции за зареждане с водород компресорите трябва да увеличат налягането на водорода до налягане за зареждане от 35MPa/70MPa, което представлява 13,4% от разходите за изграждане на външно доставяни станции за зареждане с водород. Техническите стандарти обхващат GB 4962-2008 правила за безопасност и GB/T 31138, наред с други стандарти и спецификации. Индустрията се движи към оборудване с голям капацитет от 70 MPa и първият в страната център за проверка на качеството и изпитване на оборудване за производство на водород и зареждане с гориво е одобрен за създаване.